La géologie de la Lapalala est essentiellement constituée par les anciens grès acides du Waterberg Group, sous-groupe du Kransberg. Des intrusions plus récentes de norite / épidiorite élémentaire sont trouvées dans la partie centrale.

En général, les sols provenant des grès sont dystrophiques, ce qui signifie que leur activité biologique est ralentie et qu’ils sont de faible fertilité. Les sols dérivés du substrat intrusif élémentaire sont davantage argileux et riches en nutriments.

Un total de huit différents types de terrains sont ici identifiés, ce qui démontre de l’hétérogénéité et partant de la diversité d’habitats offerts par la Lapalala.